国家博物馆位于利马市圣博尔哈区。建成于1976年，大楼共九层，是一座造型和内结构颇具特色的建筑物。1988年3月14日，根据秘鲁共和国关于建国家博物馆的最高法令，将此楼作为国家博物馆馆址。1990年2月19日开馆，同年3月1日向公众开放。
大楼共九层，地下室至四层为常设或临时展览场所。五至九层为办公室、图书馆、储藏室、安全系统等。常设展览部分主要通过模型、地图、图片、照片，出土实物，以及相应的文字说明，向观众展示西班牙人到来之前，即前印加时代和印加时代的秘鲁文明史，包括人文、农业和其他方面经济发展情况。
博物馆还举办过国内外各种绘画作品、教育、文化等题材的展览，其中包括“中国五千年文明”展。